• Login
  • Help/Guide
  • About Trac
  • Preferences
  • Wiki
  • Timeline
  • Roadmap
  • Browse Source
  • View Tickets
  • Search

Context Navigation

  • ← Previous Changeset
  • Next Changeset →

Changeset 152

Show
Ignore:
Timestamp:
02/15/08 15:32:45 (6 months ago)
Author:
andrew
Message:

Added second draft of 2008-02 schema

Location:
Xml/Working
Files:
13 modified

  • AnalysisChain.xsd (modified) (1 diff)
  • AnalysisModule.xsd (modified) (1 diff)
  • BinaryFile.xsd (modified) (1 diff)
  • CA.xsd (modified) (1 diff)
  • CLI.xsd (modified) (1 diff)
  • DataHistory.xsd (modified) (1 diff)
  • MLI.xsd (modified) (1 diff)
  • SPW.xsd (modified) (1 diff)
  • STD.xsd (modified) (1 diff)
  • completesample-local.xml (modified) (11 diffs)
  • completesamplenopre.xml (modified) (11 diffs)
  • ome.xsd (modified) (13 diffs)
  • omeOxySvnProject.xpr (modified) (1 diff)

Legend:

Unmodified
Added
Removed

  • Xml/Working/AnalysisChain.xsd

    r147 r152  
    33        #~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 
    44        # 
    5         # Copyright (C) 2003-2007 Open Microscopy Environment 
     5        # Copyright (C) 2003-2008 Open Microscopy Environment 
    66        #       Massachusetts Institute of Technology, 
    77        #       National Institutes of Health, 

  • Xml/Working/AnalysisModule.xsd

    r147 r152  
    33        #~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 
    44        # 
    5         # Copyright (C) 2003-2007 Open Microscopy Environment 
     5        # Copyright (C) 2003-2008 Open Microscopy Environment 
    66        #       Massachusetts Institute of Technology, 
    77        #       National Institutes of Health, 

  • Xml/Working/BinaryFile.xsd

    r147 r152  
    33        #~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 
    44        # 
    5         # Copyright (C) 2003-2007 Open Microscopy Environment 
     5        # Copyright (C) 2003-2008 Open Microscopy Environment 
    66        #       Massachusetts Institute of Technology, 
    77        #       National Institutes of Health, 

  • Xml/Working/CA.xsd

    r147 r152  
    33        #~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 
    44        # 
    5         # Copyright (C) 2003-2007 Open Microscopy Environment 
     5        # Copyright (C) 2003-2008 Open Microscopy Environment 
    66        #       Massachusetts Institute of Technology, 
    77        #       National Institutes of Health, 

  • Xml/Working/CLI.xsd

    r147 r152  
    33        #~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 
    44        # 
    5         # Copyright (C) 2003-2007 Open Microscopy Environment 
     5        # Copyright (C) 2003-2008 Open Microscopy Environment 
    66        #       Massachusetts Institute of Technology, 
    77        #       National Institutes of Health, 

  • Xml/Working/DataHistory.xsd

    r147 r152  
    33        #~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 
    44        # 
    5         # Copyright (C) 2003-2007 Open Microscopy Environment 
     5        # Copyright (C) 2003-2008 Open Microscopy Environment 
    66        #       Massachusetts Institute of Technology, 
    77        #       National Institutes of Health, 

  • Xml/Working/MLI.xsd

    r147 r152  
    33        #~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 
    44        # 
    5         # Copyright (C) 2003-2007 Open Microscopy Environment 
     5        # Copyright (C) 2003-2008 Open Microscopy Environment 
    66        #       Massachusetts Institute of Technology, 
    77        #       National Institutes of Health, 

  • Xml/Working/SPW.xsd

    r147 r152  
    33    #~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 
    44    # 
    5     # Copyright (C) 2003-2007 Open Microscopy Environment 
     5    # Copyright (C) 2003-2008 Open Microscopy Environment 
    66    #       Massachusetts Institute of Technology, 
    77    #       National Institutes of Health, 

  • Xml/Working/STD.xsd

    r147 r152  
    33        #~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 
    44        # 
    5         # Copyright (C) 2003-2007 Open Microscopy Environment 
     5        # Copyright (C) 2003-2008 Open Microscopy Environment 
    66        #       Massachusetts Institute of Technology, 
    77        #       National Institutes of Health, 

  • Xml/Working/completesample-local.xml

    r147 r152  
    11<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?> 
    2 <ome:OME xmlns:ca="http://www.openmicroscopy.org/Schemas/CA/2007-06" 
    3     xmlns:std="http://www.openmicroscopy.org/Schemas/STD/2007-06" 
    4     xmlns:bf="http://www.openmicroscopy.org/Schemas/BinaryFile/2007-06" 
    5     xmlns:ome="http://www.openmicroscopy.org/Schemas/OME/2007-06" 
    6     xmlns:cli="http://www.openmicroscopy.org/Schemas/CLI/2007-06" 
    7     xmlns:mli="http://www.openmicroscopy.org/Schemas/MLI/2007-06" 
    8     xmlns:spw="http://www.openmicroscopy.org/Schemas/SPW/2007-06" 
    9     xmlns:am="http://www.openmicroscopy.org/Schemas/AnalysisModule/2007-06" 
     2<ome:OME xmlns:ca="http://www.openmicroscopy.org/Schemas/CA/2008-02" 
     3    xmlns:std="http://www.openmicroscopy.org/Schemas/STD/2008-02" 
     4    xmlns:bf="http://www.openmicroscopy.org/Schemas/BinaryFile/2008-02" 
     5    xmlns:ome="http://www.openmicroscopy.org/Schemas/OME/2008-02" 
     6    xmlns:cli="http://www.openmicroscopy.org/Schemas/CLI/2008-02" 
     7    xmlns:mli="http://www.openmicroscopy.org/Schemas/MLI/2008-02" 
     8    xmlns:spw="http://www.openmicroscopy.org/Schemas/SPW/2008-02" 
     9    xmlns:am="http://www.openmicroscopy.org/Schemas/AnalysisModule/2008-02" 
    1010 xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" 
    11  xsi:schemaLocation="http://www.openmicroscopy.org/Schemas/OME/2007-06 ome.xsd" 
    12     HashMethod="SHA1"> 
     11 xsi:schemaLocation="http://www.openmicroscopy.org/Schemas/OME/2008-02 ome.xsd" 
     12    UUID="urn:uuid:b9a95980-dbd6-11dc-95ff-0800200c9a66"> 
    1313    <ome:Project Name="Name0" ID="Project:a"> 
    1414        <ome:Description> 
    … …  
    295295        </ome:OTF> 
    296296    </ome:Instrument> 
    297     <ome:Image ID="Image:a" Name="Name92" DefaultPixels="Pixels:a"> 
     297    <ome:Image ID="Image:a" Name="Name92" DefaultPixels="Pixels:a" AcquiredPixels="Pixels:a"> 
    298298        <ome:CreationDate>2006-05-04T18:13:51.0Z</ome:CreationDate> 
    299299        <ome:ExperimenterRef ID="Experimenter:a"/> 
    … …  
    338338            <bf:BinData Compression="none" Length="1">ZGVmYXVsdA==</bf:BinData> 
    339339            <bf:BinData Compression="none" Length="1">ZGVmYXVsdA==</bf:BinData> 
     340            <ome:TiffData IFD="0" FirstZ="0" FirstT="0" FirstC="0" NumPlanes="0"> 
     341                <ome:UUID FileName="thisfile.ome.tiff">urn:uuid:b9a95980-dbd6-11dc-95ff-0800200c9a66</ome:UUID> 
     342            </ome:TiffData> 
     343            <ome:Plane TheZ="0" TheT="0" TheC="0"> 
     344                <ome:PlaneTiming DeltaT="3.14159E0" ExposureTime="3.14159E0"/> 
     345                <ome:StagePosition PositionX="3.14159E0" PositionY="3.14159E0" PositionZ="3.14159E0"/> 
     346                <ome:HashSHA1>1234567890ABCDEF1234567890ABCDEF12345678</ome:HashSHA1> 
     347            </ome:Plane> 
     348        </ome:Pixels> 
     349        <ome:Pixels ID="Pixels:a" DimensionOrder="XYZCT" PixelType="int8" BigEndian="false" SizeX="2" SizeY="2" SizeZ="2" 
     350             SizeC="2" SizeT="2" PhysicalSizeX="3.14159E0" PhysicalSizeY="3.14159E0" PhysicalSizeZ="3.14159E0" 
     351             TimeIncrement="3.14159E0" WaveStart="2" WaveIncrement="2"> 
     352            <bf:BinData Compression="none" Length="1">ZGVmYXVsdA==</bf:BinData> 
     353            <bf:BinData Compression="none" Length="1">ZGVmYXVsdA==</bf:BinData> 
     354            <bf:BinData Compression="none" Length="1">ZGVmYXVsdA==</bf:BinData> 
    340355            <ome:Plane TheZ="0" TheT="0" TheC="0"> 
    341356                <ome:PlaneTiming DeltaT="3.14159E0" ExposureTime="3.14159E0"/> 
    … …  
    352367                <ome:PlaneTiming DeltaT="3.14159E0" ExposureTime="3.14159E0"/> 
    353368                <ome:StagePosition PositionX="3.14159E0" PositionY="3.14159E0" PositionZ="3.14159E0"/> 
     369                <ome:HashSHA1>1234567890ABCDEF1234567890ABCDEF12345678</ome:HashSHA1> 
    354370            </ome:Plane> 
    355371        </ome:Pixels> 
    356         <ome:Pixels ID="Pixels:a" DimensionOrder="XYZCT" PixelType="int8" BigEndian="false" SizeX="2" SizeY="2" SizeZ="2" 
    357              SizeC="2" SizeT="2" PhysicalSizeX="3.14159E0" PhysicalSizeY="3.14159E0" PhysicalSizeZ="3.14159E0" 
    358              TimeIncrement="3.14159E0" WaveStart="2" WaveIncrement="2"> 
    359             <bf:BinData Compression="none" Length="1">ZGVmYXVsdA==</bf:BinData> 
    360             <bf:BinData Compression="none" Length="1">ZGVmYXVsdA==</bf:BinData> 
    361             <bf:BinData Compression="none" Length="1">ZGVmYXVsdA==</bf:BinData> 
    362             <ome:Plane TheZ="0" TheT="0" TheC="0" Hash="1234567890ABCDEF1234567890ABCDEF12345678"> 
    363                 <ome:PlaneTiming DeltaT="3.14159E0" ExposureTime="3.14159E0"/> 
    364                 <ome:StagePosition PositionX="3.14159E0" PositionY="3.14159E0" PositionZ="3.14159E0"/> 
    365             </ome:Plane> 
    366         </ome:Pixels> 
    367         <ome:AcquiredPixelsRef ID="Pixels:a"/> 
    368372        <ome:Region Tag="Tag22" Name="Name95" ID="Region:a"> 
    369373            <ome:Region Tag="Tag23" Name="Name96" ID="Region:a"/> 
    … …  
    435439        <am:AnalysisModule isStreamAlgorithm="false" ModuleType="OME::Analysis::a" RegionIterator="RegionIterator0" NewRegionName="NewRegionName0" 
    436440             Category="Category0" ProgramID="ProgramID0" ModuleName="ModuleName0" ID="Module:a"> 
    437             <am:Description>Description3</am:Description> 
     441            <ome:Description>Description3</ome:Description> 
    438442            <am:Declaration> 
    439443                <am:FormalInput UserDefined="false" Count="+" Name=" " SemanticTypeName="SemanticTypeName0"> 
    … …  
    442446                        <am:Entry Value="Value10" Label="Label10"/> 
    443447                        <am:Entry Value="Value11" Label="Label11"/> 
    444                         <am:Description>Description4</am:Description> 
     448                        <ome:Description>Description4</ome:Description> 
    445449                    </am:LookupTable> 
    446                     <am:Description>Description5</am:Description> 
     450                    <ome:Description>Description5</ome:Description> 
    447451                </am:FormalInput> 
    448452                <am:FormalOutput IBelongTo="[Region]" Count="+" Name=" " SemanticTypeName="SemanticTypeName1"> 
    449                     <am:Description>Description6</am:Description> 
     453                    <ome:Description>Description6</ome:Description> 
    450454                </am:FormalOutput> 
    451455            </am:Declaration> 
    … …  
    541545        <am:AnalysisModule isStreamAlgorithm="false" ModuleType="OME::Analysis::a" RegionIterator="RegionIterator1" NewRegionName="NewRegionName1" 
    542546             Category="Category1" ProgramID="ProgramID1" ModuleName="ModuleName1" ID="Module:a"> 
    543             <am:Description>Description7</am:Description> 
     547            <ome:Description>Description7</ome:Description> 
    544548            <am:Declaration> 
    545549                <am:FormalInput UserDefined="false" Count="+" Name=" " SemanticTypeName="SemanticTypeName2"> 
    … …  
    548552                        <am:Entry Value="Value13" Label="Label13"/> 
    549553                        <am:Entry Value="Value14" Label="Label14"/> 
    550                         <am:Description>Description8</am:Description> 
     554                        <ome:Description>Description8</ome:Description> 
    551555                    </am:LookupTable> 
    552                     <am:Description>Description9</am:Description> 
     556                    <ome:Description>Description9</ome:Description> 
    553557                </am:FormalInput> 
    554558                <am:FormalOutput IBelongTo="[Region]" Count="+" Name=" " SemanticTypeName="SemanticTypeName3"> 
    555                     <am:Description>Description10</am:Description> 
     559                    <ome:Description>Description10</ome:Description> 
    556560                </am:FormalOutput> 
    557561            </am:Declaration> 
    … …  
    647651        <am:AnalysisModule isStreamAlgorithm="false" ModuleType="OME::Analysis::a" RegionIterator="RegionIterator2" NewRegionName="NewRegionName2" 
    648652             Category="Category2" ProgramID="ProgramID2" ModuleName="ModuleName2" ID="Module:a"> 
    649             <am:Description>Description11</am:Description> 
     653            <ome:Description>Description11</ome:Description> 
    650654            <am:Declaration> 
    651655                <am:FormalInput UserDefined="false" Count="+" Name=" " SemanticTypeName="SemanticTypeName4"> 
    … …  
    654658                        <am:Entry Value="Value16" Label="Label16"/> 
    655659                        <am:Entry Value="Value17" Label="Label17"/> 
    656                         <am:Description>Description12</am:Description> 
     660                        <ome:Description>Description12</ome:Description> 
    657661                    </am:LookupTable> 
    658                     <am:Description>Description13</am:Description> 
     662                    <ome:Description>Description13</ome:Description> 
    659663                </am:FormalInput> 
    660664                <am:FormalOutput IBelongTo="[Region]" Count="+" Name=" " SemanticTypeName="SemanticTypeName5"> 
    661                     <am:Description>Description14</am:Description> 
     665                    <ome:Description>Description14</ome:Description> 
    662666                </am:FormalOutput> 
    663667            </am:Declaration> 
    … …  
    752756        </am:AnalysisModule> 
    753757        <am:Category Path="^ $"> 
    754             <am:Description>Description15</am:Description> 
     758            <ome:Description>Description15</ome:Description> 
    755759        </am:Category> 
    756760        <am:Program Name="Name112" Version="Version0" ProgramID="ProgramID3"> 

  • Xml/Working/completesamplenopre.xml

    r85 r152  
    11<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?> 
    2 <OME xmlns:ca="http://www.openmicroscopy.org/Schemas/CA/2007-06" 
    3     xmlns:std="http://www.openmicroscopy.org/Schemas/STD/2007-06" 
    4  xmlns:bf="http://www.openmicroscopy.org/Schemas/BinaryFile/2007-06" 
    5  xmlns="http://www.openmicroscopy.org/Schemas/OME/2007-06" 
    6  xmlns:cli="http://www.openmicroscopy.org/Schemas/CLI/2007-06" 
    7  xmlns:mli="http://www.openmicroscopy.org/Schemas/MLI/2007-06" 
    8  xmlns:spw="http://www.openmicroscopy.org/Schemas/SPW/2007-06" 
    9  xmlns:am="http://www.openmicroscopy.org/Schemas/AnalysisModule/2007-06" 
     2<OME xmlns:ca="http://www.openmicroscopy.org/Schemas/CA/2008-02" 
     3    xmlns:std="http://www.openmicroscopy.org/Schemas/STD/2008-02" 
     4 xmlns:bf="http://www.openmicroscopy.org/Schemas/BinaryFile/2008-02" 
     5 xmlns="http://www.openmicroscopy.org/Schemas/OME/2008-02" 
     6 xmlns:cli="http://www.openmicroscopy.org/Schemas/CLI/2008-02" 
     7 xmlns:mli="http://www.openmicroscopy.org/Schemas/MLI/2008-02" 
     8 xmlns:spw="http://www.openmicroscopy.org/Schemas/SPW/2008-02" 
     9 xmlns:am="http://www.openmicroscopy.org/Schemas/AnalysisModule/2008-02" 
    1010 xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" 
    11  xsi:schemaLocation="http://www.openmicroscopy.org/Schemas/OME/2007-06 http://www.openmicroscopy.org/Schemas/OME/2007-06/ome.xsd"> 
     11 xsi:schemaLocation="http://www.openmicroscopy.org/Schemas/OME/2008-02 http://www.openmicroscopy.org/Schemas/OME/2008-02/ome.xsd"> 
    1212    <Project Name="Name0" ID="Project:a"> 
    1313        <Description> 
    … …  
    123123                <Pump ID="LightSource:a"/> 
    124124            </Laser> 
    125 <!--        <Filament Type="Incandescent" Power="3.14159E0"/>--> 
    126 <!--        <Arc Type="Hg" Power="3.14159E0"/>--> 
     125<!--        <Filament Type="Incandescent"/>--> 
     126<!--        <Arc Type="Hg"/>--> 
    127127        </LightSource> 
    128128        <LightSource ID="LightSource:a" Power="3.14159E0" Manufacturer="Manufacturer2" Model="Model2" SerialNumber="SerialNumber2"> 
    … …  
    131131                <Pump ID="LightSource:a"/> 
    132132            </Laser>--> 
    133             <Filament Type="Incandescent" Power="3.14159E0"/> 
    134 <!--        <Arc Type="Hg" Power="3.14159E0"/>--> 
     133            <Filament Type="Incandescent"/> 
     134<!--        <Arc Type="Hg"/>--> 
    135135        </LightSource> 
    136136        <LightSource ID="LightSource:a" Power="3.14159E0" Manufacturer="Manufacturer3" Model="Model3" SerialNumber="SerialNumber3"> 
    … …  
    139139                <Pump ID="LightSource:a"/> 
    140140            </Laser>--> 
    141 <!--        <Filament Type="Incandescent" Power="3.14159E0"/>--> 
    142             <Arc Type="Hg" Power="3.14159E0"/> 
     141<!--        <Filament Type="Incandescent"/>--> 
     142            <Arc Type="Hg"/> 
    143143        </LightSource> 
    144144        <Detector Gain="3.14159E0" Voltage="3.14159E0" Offset="3.14159E0" Zoom="3.14159E0" AmplificationGain="3.14159E0" 
    … …  
    354354        <am:AnalysisModule isStreamAlgorithm="false"  ModuleType= "OME::Analysis::a" RegionIterator="RegionIterator0" NewRegionName="NewRegionName0" 
    355355             Category="Category0" ProgramID="ProgramID0" ModuleName="ModuleName0" ID="Module:a"> 
    356             <am:Description>Description3</am:Description> 
     356            <Description>Description3</Description> 
    357357            <am:Declaration> 
    358358                <am:FormalInput UserDefined="false" Count="+" Name=" " SemanticTypeName="SemanticTypeName0"> 
    … …  
    361361                        <am:Entry Value="Value10" Label="Label10"/> 
    362362                        <am:Entry Value="Value11" Label="Label11"/> 
    363                         <am:Description>Description4</am:Description> 
     363                        <Description>Description4</Description> 
    364364                    </am:LookupTable> 
    365                     <am:Description>Description5</am:Description> 
     365                    <Description>Description5</Description> 
    366366                </am:FormalInput> 
    367367                <am:FormalOutput IBelongTo="[Region]" Count="+" Name=" " SemanticTypeName="SemanticTypeName1"> 
    368                     <am:Description>Description6</am:Description> 
     368                    <Description>Description6</Description> 
    369369                </am:FormalOutput> 
    370370            </am:Declaration> 
    … …  
    460460        <am:AnalysisModule isStreamAlgorithm="false" ModuleType="OME::Analysis::a" RegionIterator="RegionIterator1" NewRegionName="NewRegionName1" 
    461461             Category="Category1" ProgramID="ProgramID1" ModuleName="ModuleName1" ID="Module:a"> 
    462             <am:Description>Description7</am:Description> 
     462            <Description>Description7</Description> 
    463463            <am:Declaration> 
    464464                <am:FormalInput UserDefined="false" Count="+" Name=" " SemanticTypeName="SemanticTypeName2"> 
    … …  
    467467                        <am:Entry Value="Value13" Label="Label13"/> 
    468468                        <am:Entry Value="Value14" Label="Label14"/> 
    469                         <am:Description>Description8</am:Description> 
     469                        <Description>Description8</Description> 
    470470                    </am:LookupTable> 
    471                     <am:Description>Description9</am:Description> 
     471                    <Description>Description9</Description> 
    472472                </am:FormalInput> 
    473473                <am:FormalOutput IBelongTo="[Region]" Count="+" Name=" " SemanticTypeName="SemanticTypeName3"> 
    474                     <am:Description>Description10</am:Description> 
     474                    <Description>Description10</Description> 
    475475                </am:FormalOutput> 
    476476            </am:Declaration> 
    … …  
    566566        <am:AnalysisModule isStreamAlgorithm="false" ModuleType="OME::Analysis::a" RegionIterator="RegionIterator2" NewRegionName="NewRegionName2" 
    567567             Category="Category2" ProgramID="ProgramID2" ModuleName="ModuleName2" ID="Module:a"> 
    568             <am:Description>Description11</am:Description> 
     568            <Description>Description11</Description> 
    569569            <am:Declaration> 
    570570                <am:FormalInput UserDefined="false" Count="+" Name=" " SemanticTypeName="SemanticTypeName4"> 
    … …  
    573573                        <am:Entry Value="Value16" Label="Label16"/> 
    574574                        <am:Entry Value="Value17" Label="Label17"/> 
    575                         <am:Description>Description12</am:Description> 
     575                        <Description>Description12</Description> 
    576576                    </am:LookupTable> 
    577                     <am:Description>Description13</am:Description> 
     577                    <Description>Description13</Description> 
    578578                </am:FormalInput> 
    579579                <am:FormalOutput IBelongTo="[Region]" Count="+" Name=" " SemanticTypeName="SemanticTypeName5"> 
    580                     <am:Description>Description14</am:Description> 
     580                    <Description>Description14</Description> 
    581581                </am:FormalOutput> 
    582582            </am:Declaration> 
    … …  
    671671        </am:AnalysisModule> 
    672672        <am:Category Path="^ $"> 
    673             <am:Description>Description15</am:Description> 
     673            <Description>Description15</Description> 
    674674        </am:Category> 
    675675        <am:Program Name="Name112" Version="Version0" ProgramID="ProgramID3"> 

  • Xml/Working/ome.xsd

    r147 r152  
    33        #~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 
    44        # 
    5         # Copyright (C) 2002-2007 Open Microscopy Environment 
     5        # Copyright (C) 2002-2008 Open Microscopy Environment 
    66        #       Massachusetts Institute of Technology, 
    77        #       National Institutes of Health, 
    … …  
    3636                <xsd:documentation> 
    3737                        Open Microscopy Environment 
    38                         OME XML Schema June 2007 - Update Version 2 September 2007 
     38                        OME XML Schema February 2008 - Version 1 
    3939                        Author:  Ilya G. Goldberg, Andrew J Patterson 
    40                         Copyright 2002 - 2007 OME. All rights reserved. 
     40                        Copyright 2002 - 2008 OME. All rights reserved. 
    4141                </xsd:documentation> 
    4242        </xsd:annotation> 
    … …  
    6565                                <xsd:element ref="CA:CustomAttributes" minOccurs="0"/> 
    6666                        </xsd:sequence> 
    67                                 <xsd:attribute name="ID" type="FileID"/> 
    68                                 <xsd:attribute name="HashMethod" type="HashMethodType" default="SHA1"/> 
     67                                <xsd:attribute name="UUID" type="UniversallyUniqueIdentifier"/> 
    6968                </xsd:complexType> 
    7069        </xsd:element> 
    … …  
    103102                                <xsd:element ref="StageLabel" minOccurs="0"/> 
    104103                                <xsd:element ref="Pixels" maxOccurs="unbounded"/> 
    105                                 <xsd:element ref="AcquiredPixelsRef" minOccurs="0" maxOccurs="1"/> 
    106104                                <xsd:element ref="Region" minOccurs="0" maxOccurs="unbounded"/> 
    107105                                <xsd:element ref="CA:CustomAttributes" minOccurs="0"/> 
    … …  
    113111                        <xsd:attribute name="DefaultPixels" use="required" type="PixelsID"> 
    114112                                <xsd:annotation> 
    115                                         <xsd:documentation>More than one Pixels attribute may be associated with an Image. An Image will however have one "primary" set of Pixels. If a PixelsID is specified with this attribute, then that will be the "primary" pixels for this image. If this attribute 
    116 is not specified, then the FIRST &lt;Pixels> element under &lt;Image> will be assumed to be the "primary" set. 
     113                                        <xsd:documentation> 
     114                                                More than one Pixels element may be associated with an Image.  
     115                                                An Image will however have one "primary" set of Pixels specified with this attribute. 
     116                                        </xsd:documentation> 
     117                                </xsd:annotation> 
     118                        </xsd:attribute> 
     119                        <xsd:attribute name="AcquiredPixels" type="PixelsID"> 
     120                                <xsd:annotation> 
     121                                        <xsd:documentation> 
     122                                                Optional.  
     123                                                More than one Pixels element may be associated with an Image.  
     124                                                This attribute indicates the original acquired pixels. 
    117125                                        </xsd:documentation> 
    118126                                </xsd:annotation> 
    … …  
    210218                </xsd:complexType> 
    211219        </xsd:element> 
    212          
    213         <xsd:element name="AcquiredPixelsRef"> 
    214                 <xsd:complexType> 
    215                         <xsd:complexContent> 
    216                                 <xsd:extension base="Reference"> 
    217                                         <xsd:attribute name="ID" use="required" type="PixelsID"/> 
    218                                 </xsd:extension> 
    219                         </xsd:complexContent> 
    220                 </xsd:complexType> 
    221         </xsd:element> 
    222                                  
    223220        <xsd:element name="TiffData"> 
    224221                <xsd:annotation> 
    … …  
    228225                </xsd:annotation> 
    229226                <xsd:complexType> 
     227                        <xsd:sequence> 
     228                                <xsd:element name="UUID" minOccurs="0"> 
     229                                        <xsd:annotation> 
     230                                                <xsd:documentation> 
     231                                                        This must be used when the IFDs are located in another file. 
     232                                                        Note: It is permissible for this to be self referential. 
     233                                                </xsd:documentation> 
     234                                        </xsd:annotation> 
     235                                        <xsd:complexType> 
     236                                                <xsd:simpleContent> 
     237                                                        <xsd:extension base = "UniversallyUniqueIdentifier"> 
     238                                                                <xsd:attribute name="FileName" type="xsd:string"> 
     239                                                                        <xsd:annotation> 
     240                                                                                <xsd:documentation> 
     241                                                                                        This can be used when the IFDs are located in another file. 
     242                                                                                        The / (forward slash) is used as the path separator. 
     243                                                                                        A relative path is recommended. However an absolute path can be specified. 
     244                                                                                        Default is to use the file the ome-xml data has been pulled from. 
     245                                                                                        Note: It is permissible for this to be self referential. The file image1.tiff 
     246                                                                                        may contain ome-xml data that has FilePath="image1.tiff" or "./image1.tiff" 
     247                                                                                </xsd:documentation> 
     248                                                                        </xsd:annotation> 
     249                                                                </xsd:attribute> 
     250                                                        </xsd:extension> 
     251                                                </xsd:simpleContent> 
     252