• Login
  • Help/Guide
  • About Trac
  • Preferences
  • Wiki
  • Timeline
  • Roadmap
  • Browse Source
  • View Tickets
  • Search

Context Navigation

  • ← Previous Change
  • Next Change →

Changeset 195 for Xml/Working/SPW.xsd

Show
Ignore:
Timestamp:
09/10/08 12:03:10 (4 months ago)
Author:
andrew
Message:

Version presented in meeting 10th Sept 2008

Files:
1 modified

  • Xml/Working/SPW.xsd (modified) (1 diff)

Legend:

Unmodified
Added
Removed

  • Xml/Working/SPW.xsd

    r189 r195  
    11<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?> 
    22<!-- 
    3     #~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 
    4     # 
    5     # Copyright (C) 2003-2008 Open Microscopy Environment 
    6     #       Massachusetts Institute of Technology, 
    7     #       National Institutes of Health, 
    8     #       University of Dundee, 
    9     #       University of Wisconsin at Madison 
    10     # 
    11     #~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 
     3        #~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 
     4        # 
     5        # Copyright (C) 2003-2008 Open Microscopy Environment 
     6        #               Massachusetts Institute of Technology, 
     7        #               National Institutes of Health, 
     8        #               University of Dundee, 
     9        #               University of Wisconsin at Madison 
     10        # 
     11        #~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 
    1212--> 
    1313<!-- 
    14     #~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 
    15     # Written by:  Andrew Patterson <ajpatterson@lifesci.dundee.ac.uk> 
    16     #~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 
     14        #~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 
     15        # Written by:  Andrew Patterson <ajpatterson@lifesci.dundee.ac.uk> 
     16        #~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 
    1717--> 
    1818<xsd:schema xmlns="http://www.openmicroscopy.org/Schemas/SPW/2008-02"  
    19     targetNamespace="http://www.openmicroscopy.org/Schemas/SPW/2008-02"  
    20     xmlns:OME="http://www.openmicroscopy.org/Schemas/OME/2008-02"  
    21     xmlns:xsd="http://www.w3.org/2001/XMLSchema"  
    22     version="1"  
    23     elementFormDefault="qualified"> 
    24     <xsd:import namespace="http://www.openmicroscopy.org/Schemas/OME/2008-02" schemaLocation="http://www.openmicroscopy.org/Schemas/OME/2008-02/ome.xsd"/> 
    25  
    26     <xsd:annotation> 
    27         <xsd:documentation> 
    28             Open Microscopy Environment 
    29             Screen, Plate, and Well XML Schema 
    30             Author: Andrew J Patterson 
    31         </xsd:documentation> 
    32     </xsd:annotation> 
    33  
    34     <xsd:element name="Plate"> 
    35         <xsd:annotation> 
    36             <xsd:documentation> 
    37                 This element identifies microtiter plates within a screen. 
    38                 A plate can belong to more than one screen. 
    39                 The Screen(s) that a plate belongs to are specified by the ScreenRef element. 
    40                 The Plate ID and Name attributes are required. 
     19        targetNamespace="http://www.openmicroscopy.org/Schemas/SPW/2008-02"  
     20        xmlns:OME="http://www.openmicroscopy.org/Schemas/OME/2008-02"  
     21        xmlns:xsd="http://www.w3.org/2001/XMLSchema"  
     22        version="1"  
     23        elementFormDefault="qualified"> 
     24        <xsd:import namespace="http://www.openmicroscopy.org/Schemas/OME/2008-02" schemaLocation="http://www.openmicroscopy.org/Schemas/OME/2008-02/ome.xsd"/> 
     25 
     26        <xsd:annotation> 
     27                <xsd:documentation> 
     28                        Open Microscopy Environment 
     29                        Screen, Plate, and Well XML Schema 
     30                        Author: Andrew J Patterson 
     31                </xsd:documentation> 
     32        </xsd:annotation> 
     33 
     34        <xsd:element name="Plate"> <!-- top level definition --> 
     35                <xsd:annotation> 
     36                        <xsd:documentation> 
     37                                This element identifies microtiter plates within a screen. 
     38                                A plate can belong to more than one screen. 
     39                                The Screen(s) that a plate belongs to are specified by the ScreenRef element. 
     40                                The Plate ID and Name attributes are required. 
    4141                                The Wells in a plate are numbers from the top-left corner in a grid starting at zero. 
    4242                                i.e The top-left well of a plate is index (0,0) 
    43             </xsd:documentation> 
    44         </xsd:annotation> 
    45         <xsd:complexType> 
    46             <xsd:sequence> 
    47                 <xsd:element ref="ScreenRef" minOccurs="0" maxOccurs="unbounded"/> 
    48                 <xsd:element ref="Well" minOccurs="0" maxOccurs="unbounded"/> 
    49             </xsd:sequence> 
    50             <xsd:attribute name="ID" use="required" type="PlateID"/> 
    51             <xsd:attribute name="Name" use="required" type="xsd:string"> 
    52                     <xsd:annotation> 
    53                         <xsd:documentation> 
    54                                     The Name identifies the plate to the user.  It is used much like the  
    55                                                 ID, and so must be unique within the document. 
    56                         </xsd:documentation> 
    57                     </xsd:annotation>            
    58                         </xsd:attribute> 
    59             <xsd:attribute name="Description" type="xsd:string"/> 
    60             <xsd:attribute name="Status" type="xsd:string"> 
    61                     <xsd:annotation> 
    62                         <xsd:documentation> 
    63                                 A textual annotation of the current state of the plate with respect to the  
     43                        </xsd:documentation> 
     44                </xsd:annotation> 
     45                <xsd:complexType> 
     46                        <xsd:sequence> 
     47                                <xsd:element ref="ScreenRef" minOccurs="0" maxOccurs="unbounded"/> 
     48                                <xsd:element ref="Well" minOccurs="0" maxOccurs="unbounded"/> 
     49                        </xsd:sequence> 
     50                        <xsd:attribute name="ID" use="required" type="PlateID"/> 
     51                        <xsd:attribute name="Name" use="required" type="xsd:string"> 
     52                                <xsd:annotation> 
     53                                        <xsd:documentation> 
     54                                                The Name identifies the plate to the user.      It is used much like the  
     55                                                ID, and so must be unique within the document. 
     56                                        </xsd:documentation> 
     57                                </xsd:annotation>                
     58                        </xsd:attribute> 
     59                        <xsd:attribute name="Description" use="optional" type="xsd:string"/> 
     60                        <xsd:attribute name="Status" use="optional" type="xsd:string"> 
     61                                <xsd:annotation> 
     62                                        <xsd:documentation> 
     63                                                A textual annotation of the current state of the plate with respect to the  
    6464                                                experiment work-flow; e.g. 
    6565                                                1. Seed cell: done; 2. Transfection: done;      3. Gel doc: todo. 
    66                         </xsd:documentation> 
    67                     </xsd:annotation> 
    68                         </xsd:attribute> 
    69             <xsd:attribute name="ExternalIdentifier" type="xsd:string"> 
    70                 <xsd:annotation> 
    71                     <xsd:documentation> 
    72                         The ExternalIdentifier attribute may contain a reference to an external database. 
    73                     </xsd:documentation> 
    74                 </xsd:annotation>        
    75                         </xsd:attribute> 
    76         </xsd:complexType> 
    77     </xsd:element> 
    78  
    79     <xsd:element name="PlateRef"> 
    80         <xsd:annotation> 
    81             <xsd:documentation> 
    82                 The PlateRef element is a reference to a Plate element. 
    83                 Screen elements may have one or more PlateRef elements to define the plates that are part of the screen. 
    84                 Plates may belong to more than one screen. 
    85             </xsd:documentation> 
    86         </xsd:annotation> 
    87         <xsd:complexType> 
    88             <xsd:complexContent> 
    89                 <xsd:extension base="OME:Reference"> 
    90                     <xsd:attribute name="ID" use="required" type="PlateID"/> 
    91                 </xsd:extension> 
    92             </xsd:complexContent> 
    93         </xsd:complexType> 
    94     </xsd:element> 
    95  
    96     <xsd:simpleType name="PlateID"> 
    97         <xsd:restriction base="OME:LSID"> 
    98             <xsd:pattern value="(urn:lsid:([\w\-\.]+\.[\w\-\.]+)+:Plate:\S+)|(Plate:\S+)"/> 
    99         </xsd:restriction> 
    100     </xsd:simpleType> 
    101  
    102     <xsd:element name="Reagent"> 
    103         <xsd:annotation> 
    104             <xsd:documentation> 
    105                 Reagent is used to describe a chemical or some other physical experimental parameter. 
    106             </xsd:documentation> 
    107         </xsd:annotation>       
    108         <xsd:complexType> 
    109             <xsd:attribute name="ID" use="required" type="ReagentID"/> 
    110             <xsd:attribute name="Description" type="xsd:string"> 
    111                 <xsd:annotation> 
    112                     <xsd:documentation> 
     66                                        </xsd:documentation> 
     67                                </xsd:annotation> 
     68                        </xsd:attribute> 
     69                        <xsd:attribute name="ExternalIdentifier" use="optional" type="xsd:string"> 
     70                                <xsd:annotation> 
     71                                        <xsd:documentation> 
     72                                                The ExternalIdentifier attribute may contain a reference to an external database. 
     73                                        </xsd:documentation> 
     74                                </xsd:annotation>                
     75                        </xsd:attribute> 
     76                </xsd:complexType> 
     77        </xsd:element> 
     78 
     79        <xsd:element name="PlateRef"> <!-- top level definition --> 
     80                <xsd:annotation> 
     81                        <xsd:documentation> 
     82                                The PlateRef element is a reference to a Plate element. 
     83                                Screen elements may have one or more PlateRef elements to define the plates that are part of the screen. 
     84                                Plates may belong to more than one screen. 
     85                        </xsd:documentation> 
     86                </xsd:annotation> 
     87                <xsd:complexType> 
     88                        <xsd:complexContent> 
     89                                <xsd:extension base="OME:Reference"> 
     90                                        <xsd:attribute name="ID" use="required" type="PlateID"/> 
     91                                </xsd:extension> 
     92                        </xsd:complexContent> 
     93                </xsd:complexType> 
     94        </xsd:element> 
     95 
     96        <xsd:simpleType name="PlateID"> 
     97                <xsd:restriction base="OME:LSID"> 
     98                        <xsd:pattern value="(urn:lsid:([\w\-\.]+\.[\w\-\.]+)+:Plate:\S+)|(Plate:\S+)"/> 
     99                </xsd:restriction> 
     100        </xsd:simpleType> 
     101 
     102        <xsd:element name="Reagent"> <!-- top level definition --> 
     103                <xsd:annotation> 
     104                        <xsd:documentation> 
     105                                Reagent is used to describe a chemical or some other physical experimental parameter. 
     106                        </xsd:documentation> 
     107                </xsd:annotation>           
     108                <xsd:complexType> 
     109                        <xsd:attribute name="ID" use="required" type="ReagentID"/> 
     110                        <xsd:attribute name="Description" use="optional" type="xsd:string"> 
     111                                <xsd:annotation> 
     112                                        <xsd:documentation> 
    113113                                                A long description for the reagent 
    114                     </xsd:documentation> 
    115                 </xsd:annotation>                    
    116             </xsd:attribute> 
    117             <xsd:attribute name="Name" type="xsd:string"> 
    118                 <xsd:annotation> 
    119                     <xsd:documentation> 
     114                                        </xsd:documentation> 
     115                                </xsd:annotation>                                        
     116                        </xsd:attribute> 
     117                        <xsd:attribute name="Name" use="optional" type="xsd:string"> 
     118                                <xsd:annotation> 
     119                                        <xsd:documentation> 
    120120                                                A short name for the reagent 
    121                     </xsd:documentation> 
    122                 </xsd:annotation>                 
    123             </xsd:attribute> 
    124             <xsd:attribute name="ReagentIdentifier" type="xsd:string"> 
    125                 <xsd:annotation> 
    126                     <xsd:documentation> 
    127                         This is a reference to an external (to OME) representation of the Reagent. 
    128                         It serves as a foreign key into an external database. - It is sometimes refereed to as ExternalIdentifier. 
    129                     </xsd:documentation> 
    130                 </xsd:annotation>       
    131             </xsd:attribute> 
    132        </xsd:complexType> 
    133     </xsd:element> 
    134  
    135     <xsd:element name="ReagentRef"> 
    136         <xsd:complexType> 
    137             <xsd:complexContent> 
    138                 <xsd:extension base="OME:Reference"> 
    139                     <xsd:attribute name="ID" use="required" type="ReagentID"/> 
    140                 </xsd:extension> 
    141             </xsd:complexContent> 
    142         </xsd:complexType> 
    143     </xsd:element> 
    144      
    145     <xsd:simpleType name="ReagentID"> 
    146         <xsd:restriction base="OME:LSID"> 
    147             <xsd:pattern value="(urn:lsid:([\w\-\.]+\.[\w\-\.]+)+:Reagent:\S+)|(Reagent:\S+)"/> 
    148         </xsd:restriction> 
    149     </xsd:simpleType> 
    150  
    151     <xsd:element name="Screen"> 
    152         <xsd:annotation> 
    153             <xsd:documentation> 
    154                 The Screen element is a grouping for Plates. 
    155                 The required attribute is the Screen's Name and ID - both must be unique within the document. 
    156                 The Screen element may contain an ExternalRef attribute that refers to an external database. 
    157                 A description of the screen may be specified in the Description element. 
    158                 Screens may contain overlapping sets of Plates i.e. Screens and Plates have a many-to-many relationship. 
    159                 Plates contain one or more ScreenRef elements to specify what screens they belong to. 
    160             </xsd:documentation> 
    161         </xsd:annotation> 
    162         <xsd:complexType> 
    163             <xsd:sequence> 
    164                 <xsd:element ref="OME:Description" minOccurs="0"/> 
    165                 <xsd:element ref="Reagent" minOccurs="0" maxOccurs="unbounded"/> 
    166                 <xsd:element ref="PlateRef" minOccurs="0" maxOccurs="unbounded"/> 
    167                 <xsd:element ref="ScreenAcquisition" minOccurs="0" maxOccurs="unbounded"/> 
    168             </xsd:sequence> 
    169             <xsd:attribute name="ID" use="required" type="ScreenID"/> 
    170             <xsd:attribute name="Name" use="required" type="xsd:string"/> 
    171             <xsd:attribute name="ProtocolIdentifier" type="xsd:string"> 
    172                                 <xsd:annotation> 
    173                                     <xsd:documentation> 
     121                                        </xsd:documentation> 
     122                                </xsd:annotation>                                 
     123                        </xsd:attribute> 
     124                        <xsd:attribute name="ReagentIdentifier" use="optional" type="xsd:string"> 
     125                                <xsd:annotation> 
     126                                        <xsd:documentation> 
     127                                                This is a reference to an external (to OME) representation of the Reagent. 
     128                                                It serves as a foreign key into an external database. - It is sometimes refereed to as ExternalIdentifier. 
     129                                        </xsd:documentation> 
     130                                </xsd:annotation>           
     131                        </xsd:attribute> 
     132           </xsd:complexType> 
     133        </xsd:element> 
     134 
     135        <xsd:element name="ReagentRef"> <!-- top level definition --> 
     136                <xsd:complexType> 
     137                        <xsd:complexContent> 
     138                                <xsd:extension base="OME:Reference"> 
     139                                        <xsd:attribute name="ID" use="required" type="ReagentID"/> 
     140                                </xsd:extension> 
     141                        </xsd:complexContent> 
     142                </xsd:complexType> 
     143        </xsd:element> 
     144         
     145        <xsd:simpleType name="ReagentID"> 
     146                <xsd:restriction base="OME:LSID"> 
     147                        <xsd:pattern value="(urn:lsid:([\w\-\.]+\.[\w\-\.]+)+:Reagent:\S+)|(Reagent:\S+)"/> 
     148                </xsd:restriction> 
     149        </xsd:simpleType> 
     150 
     151        <xsd:element name="Screen"> <!-- top level definition --> 
     152                <xsd:annotation> 
     153                        <xsd:documentation> 
     154                                The Screen element is a grouping for Plates. 
     155                                The required attribute is the Screen's Name and ID - both must be unique within the document. 
     156                                The Screen element may contain an ExternalRef attribute that refers to an external database. 
     157                                A description of the screen may be specified in the Description element. 
     158                                Screens may contain overlapping sets of Plates i.e.      Screens and Plates have a many-to-many relationship. 
     159                                Plates contain one or more ScreenRef elements to specify what screens they belong to. 
     160                        </xsd:documentation> 
     161                </xsd:annotation> 
     162                <xsd:complexType> 
     163                        <xsd:sequence> 
     164                                <xsd:element ref="OME:Description" minOccurs="0" maxOccurs="1"/> 
     165                                <xsd:element ref="Reagent" minOccurs="0" maxOccurs="unbounded"/> 
     166                                <xsd:element ref="PlateRef" minOccurs="0" maxOccurs="unbounded"/> 
     167                                <xsd:element ref="ScreenAcquisition" minOccurs="0" maxOccurs="unbounded"/> 
     168                        </xsd:sequence> 
     169                        <xsd:attribute name="ID" use="required" type="ScreenID"/> 
     170                        <xsd:attribute name="Name" use="required" type="xsd:string"/> 
     171                        <xsd:attribute name="ProtocolIdentifier" use="optional" type="xsd:string"> 
     172                                        <xsd:annotation> 
     173                                                <xsd:documentation> 
    174174                                                        A pointer to an externally defined protocol, usually in a screening database. 
    175                                     </xsd:documentation> 
    176                                 </xsd:annotation> 
     175                                                </xsd:documentation> 
     176                                        </xsd:annotation> 
    177177                                </xsd:attribute>         
    178             <xsd:attribute name="ProtocolDescription" type="xsd:string"> 
    179                                 <xsd:annotation> 
    180                                     <xsd:documentation> 
     178                        <xsd:attribute name="ProtocolDescription" use="optional" type="xsd:string"> 
     179                                        <xsd:annotation> 
     180                                                <xsd:documentation> 
    181181                                                        A description of the screen protocol; may contain very detailed information to  
    182182                                                        reproduce some of that found in a screening database. 
    183                                     </xsd:documentation> 
    184                                 </xsd:annotation> 
     183                                                </xsd:documentation> 
     184                                        </xsd:annotation> 
    185185                                </xsd:attribute>         
    186             <xsd:attribute name="ReagentSetDescription" type="xsd:string"> 
    187                                 <xsd:annotation> 
    188                                     <xsd:documentation> 
     186                        <xsd:attribute name="ReagentSetDescription" use="optional" type="xsd:string"> 
     187                                        <xsd:annotation> 
     188                                                <xsd:documentation> 
    189189                                                        A description of the set of reagents; may contain very detailed information to 
    190190                                                        reproduce some of that information found in a screening database. 
    191                                     </xsd:documentation> 
    192                                 </xsd:annotation> 
     191                                                </xsd:documentation> 
     192                                        </xsd:annotation> 
    193193                                </xsd:attribute>         
    194             <xsd:attribute name="ReagentSetIdentifier" type="xsd:string"> 
    195                                 <xsd:annotation> 
    196                                     <xsd:documentation> 
     194                        <xsd:attribute name="ReagentSetIdentifier" use="optional" type="xsd:string"> 
     195                                        <xsd:annotation> 
     196                                                <xsd:documentation> 
    197197                                                        A pointer to an externally defined set of reagents, usually in a screening  
    198198                                                        database/automation database. 
    199                                     </xsd:documentation> 
    200                                 </xsd:annotation> 
     199                                                </xsd:documentation> 
     200                                        </xsd:annotation> 
    201201                                </xsd:attribute>         
    202             <xsd:attribute name="Type" type="xsd:string"> 
    203                         <xsd:annotation> 
    204                             <xsd:documentation> 
     202                        <xsd:attribute name="Type" use="optional" type="xsd:string"> 
     203                                <xsd:annotation> 
     204                                        <xsd:documentation> 
    205205                                                A human readable identifier for the screen type; e.g. RNAi, cDNA, SiRNA, etc. 
    206206                                                This string is likely to become an enumeration in future releases. 
    207                             </xsd:documentation> 
    208                         </xsd:annotation> 
     207                                        </xsd:documentation> 
     208                                </xsd:annotation> 
    209209                        </xsd:attribute>         
    210         </xsd:complexType> 
    211     </xsd:element> 
    212  
    213     <xsd:simpleType name="ScreenID"> 
    214         <xsd:restriction base="OME:LSID"> 
    215             <xsd:pattern value="(urn:lsid:([\w\-\.]+\.[\w\-\.]+)+:Screen:\S+)|(Screen:\S+)"/> 
    216         </xsd:restriction> 
    217     </xsd:simpleType> 
    218  
    219     <xsd:element name="ScreenRef"> 
    220         <xsd:annotation> 
    221             <xsd:documentation> 
    222                 The ScreenRef element is a reference to a Screen element. 
    223                 Plate elements may have one or more ScreenRef elements to define the screen that a plate belongs to. 
    224                 Plates may belong to more than one screen. 
    225             </xsd:documentation> 
    226         </xsd:annotation> 
    227         <xsd:complexType> 
    228             <xsd:complexContent> 
    229                 <xsd:extension base="OME:Reference"> 
    230                     <xsd:attribute name="ID" use="required" type="ScreenID"/> 
    231                 </xsd:extension> 
    232             </xsd:complexContent> 
    233         </xsd:complexType> 
    234     </xsd:element> 
    235      
    236     <xsd:element name="ScreenAcquisition"> 
    237         <xsd:annotation> 
    238             <xsd:documentation> 
    239                 ScreenAcquisition is used to describe a single acquisition run for a screen. 
    240                 Since Screens are abstract, this object is used to record the set of images 
    241                 acquired in a single acquisition run.  The Images for this run are linked 
    242                 to ScreenAcquisition through WellSample. 
    243             </xsd:documentation> 
    244         </xsd:annotation>      
    245         <xsd:complexType> 
    246             <xsd:sequence> 
    247                 <xsd:element ref="WellSampleRef" minOccurs="0" maxOccurs="unbounded"/> 
    248             </xsd:sequence> 
    249             <xsd:attribute name="ID" use="required" type="ScreenAcquisitionID"/> 
    250             <xsd:attribute name="EndTime" type="xsd:dateTime"> 
    251                 <xsd:annotation> 
    252                     <xsd:documentation> 
     210                </xsd:complexType> 
     211        </xsd:element> 
     212 
     213        <xsd:simpleType name="ScreenID"> 
     214                <xsd:restriction base="OME:LSID"> 
     215                        <xsd:pattern value="(urn:lsid:([\w\-\.]+\.[\w\-\.]+)+:Screen:\S+)|(Screen:\S+)"/> 
     216                </xsd:restriction> 
     217        </xsd:simpleType> 
     218 
     219        <xsd:element name="ScreenRef">  <!-- top level definition --> 
     220                <xsd:annotation> 
     221                        <xsd:documentation> <!-- top level definition --> 
     222                                The ScreenRef element is a reference to a Screen element. 
     223                                Plate elements may have one or more ScreenRef elements to define the screen that a plate belongs to. 
     224                                Plates may belong to more than one screen. 
     225                        </xsd:documentation> 
     226                </xsd:annotation> 
     227                <xsd:complexType> 
     228                        <xsd:complexContent> 
     229                                <xsd:extension base="OME:Reference"> 
     230                                        <xsd:attribute name="ID" use="required" type="ScreenID"/> 
     231                                </xsd:extension> 
     232                        </xsd:complexContent> 
     233                </xsd:complexType> 
     234        </xsd:element> 
     235         
     236        <xsd:element name="ScreenAcquisition"> <!-- top level definition --> 
     237                <xsd:annotation> 
     238                        <xsd:documentation> 
     239                                ScreenAcquisition is used to describe a single acquisition run for a screen. 
     240                                Since Screens are abstract, this object is used to record the set of images 
     241                                acquired in a single acquisition run.  The Images for this run are linked 
     242                                to ScreenAcquisition through WellSample. 
     243                        </xsd:documentation> 
     244                </xsd:annotation>          
     245                <xsd:complexType> 
     246                        <xsd:sequence> 
     247                                <xsd:element ref="WellSampleRef" minOccurs="0" maxOccurs="unbounded"/> 
     248                        </xsd:sequence> 
     249                        <xsd:attribute name="ID" use="required" type="ScreenAcquisitionID"/> 
     250                        <xsd:attribute name="EndTime" use="optional" type="xsd:dateTime"> 
     251                                <xsd:annotation> 
     252                                        <xsd:documentation> 
    253253                                                Time when the last image of this acquisition was collected 
    254                     </xsd:documentation> 
    255                 </xsd:annotation>      
    256             </xsd:attribute> 
    257             <xsd:attribute name="StartTime" type="xsd:dateTime"> 
    258                 <xsd:annotation> 
    259                     <xsd:documentation> 
     254                                        </xsd:documentation> 
     255                                </xsd:annotation>          
     256                        </xsd:attribute> 
     257                        <xsd:attribute name="StartTime" use="optional" type="xsd:dateTime"> 
     258                                <xsd:annotation> 
     259                                        <xsd:documentation> 
    260260                                                Time when the first image of this acquisition was collected 
    261                     </xsd:documentation> 
    262                 </xsd:annotation>      
    263             </xsd:attribute> 
    264         </xsd:complexType> 
    265     </xsd:element> 
    266  
    267     <xsd:simpleType name="ScreenAcquisitionID"> 
    268         <xsd:restriction base="OME:LSID"> 
    269             <xsd:pattern value="(urn:lsid:([\w\-\.]+\.[\w\-\.]+)+:ScreenAcquisition:\S+)|(ScreenAcquisition:\S+)"/> 
    270         </xsd:restriction> 
    271     </xsd:simpleType> 
    272  
    273     <xsd:element name="Well"> 
    274         <xsd:annotation> 
    275             <xsd:documentation> 
    276                 A Well is a component of the Well/Plate/Screen construct to describe screening applications. 
    277                 A Well has a number of WellSample elements that link to the Images collected in this well. 
    278                                 The ReagentRef links any Reagents that were used in this Well. A well is part of only one Plate. 
     261                                        </xsd:documentation> 
     262                                </xsd:annotation>